Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms