Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CADM1Q9BY67 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms