Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAPERQ9BY12 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAPERQ9BY12 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms