Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms