Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAGR1Q9BTK6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms