Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS4Q9BT78 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms