Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNS3Q9BQ31 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms