Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms