Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RBBP8Q99708 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBBP8Q99708 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms