Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUDCD1Q96RS6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUDCD1Q96RS6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms