Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms