Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

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Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC17Q96LX7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC17Q96LX7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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