Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EP400Q96L91 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EP400Q96L91 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms