Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms