Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TPD52L3Q96J77 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms