Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCC12Q96J65 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCC12Q96J65 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms