Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms