Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNFT2Q96EX2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms