Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms