Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM52Q96A61 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM52Q96A61 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms