Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPS3Q969F9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms