Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HLA-CQ95604 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms