Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRG4Q92954 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRG4Q92954 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms