Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBXN4Q92575 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms