Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms