Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms