Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPTSSBQ8NFR3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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