Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGDNQ8NEJ9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGDNQ8NEJ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms