Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00116Q8NCU8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00116Q8NCU8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms