Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VWDEQ8N2E2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWDEQ8N2E2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms