Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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UBE2Q1Q7Z7E8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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UBE2Q1Q7Z7E8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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