Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPOCD1Q6ZMY3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms