Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF7Q6Q0C0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms