Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6P435 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6P435 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6P435 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6P435 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms