Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ANKRD54Q6NXT1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms