Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms