Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L1Q676U5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L1Q676U5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms