Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF123Q5XPI4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms