Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USPL1Q5W0Q7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USPL1Q5W0Q7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms