Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN4Q5BKX8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms