Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTXN3Q4LDR2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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