Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q499Y3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q499Y3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q499Y3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q499Y3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q499Y3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q499Y3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q499Y3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q499Y3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q499Y3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q499Y3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q499Y3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms