Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms