Protein–RNA interactions for Protein: Q2M389

WASHC4, WASH complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC4Q2M389 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WASHC4Q2M389 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms