Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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