Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC6Q16204 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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