Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NEDD8Q15843 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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NEDD8Q15843 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEDD8Q15843 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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