Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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