Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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UBE3CQ15386 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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UBE3CQ15386 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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