Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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